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据了解，这种生物厕所没有传统的水箱，取而代之的关键部件是发酵槽。当排泄物进入发酵槽后，螺旋推进器转动起来，将木屑和排泄物混合搅拌，同时自动温控发酵槽将温度设定到适宜微生物生存的最佳数值。然后微生物就开始“大展拳脚”，进行分解了。
一种新型的不需要冲水的智能型生态厕所目前被研制出来。“智能型生态厕所的清理不需要水冲、不需要埋设排污管道，也不需要水源。它完全靠的是生物降解的技术。”上海新张环保设备科技有限公司负责人告诉《北京科技报》，生态厕所用特殊的微生物菌种使污物在15小时内就能降解，同时还能分解手纸，微生物菌种能释放出具有降解有机物功能的高蛋白酶，这些酶将大分子有机物降解为糖、脂肪酸和氨基酸等小分子有机物。而这些就是微生物赖以存活的“粮食”，经过它们的一番“消化”，微生物最终的代谢产物就是二氧化碳、水、气体以及极少量的残渣，这些富含氮、磷、钾的残渣还可以作为高效有机肥料回收利用。不但污物被分解了，微生物分解过程中产生的60℃左右的高温还可以杀死污物中的病原体，生态厕所可以随时安放在任何需要的地方。
   生态厕所还大大节省了用水。普通的水冲式厕所，需要将污物纳入排污管道，然后再排放到处理厂进行分解处理，这一过程中的用水量极大，而生物分解式厕所每天的用水量只有传统方法的5 % 左右，大大节约了水资源。